Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY2Q8WXA3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY2Q8WXA3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms