Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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