Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM43BQ6ZT52 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM43BQ6ZT52 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms