Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms