Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZCCHC12Q6PEW1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms