Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP5Q6NZY7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms