Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Hbq1bQ3U0A6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Hbq1bQ3U0A6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Hbq1bQ3U0A6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Hbq1bQ3U0A6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Hbq1bQ3U0A6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Hbq1bQ3U0A6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Hbq1bQ3U0A6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Hbq1bQ3U0A6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Hbq1bQ3U0A6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Hbq1bQ3U0A6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hbq1bQ3U0A6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms