Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms