Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZFHX3Q15911 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms