Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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