Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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PEX6Q13608 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX6Q13608 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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