Protein–RNA interactions for Protein: Q13231

CHIT1, Chitotriosidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIT1Q13231 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHIT1Q13231 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms