Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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GTF3C1Q12789 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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GTF3C1Q12789 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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GTF3C1Q12789 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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GTF3C1Q12789 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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GTF3C1Q12789 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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GTF3C1Q12789 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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