Protein–RNA interactions for Protein: Q12340

YRM1, Zinc finger transcription factor YRM1, yeastyeast

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRM1Q12340 COY1YKL179C 2040 nt0.88□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.88□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.88□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.88□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.88□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 YEL014CYEL014C 306 nt0.87□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 snR46snR46 197 nt0.87□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.86□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 YJL182CYJL182C 318 nt0.86□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 YGR151CYGR151C 336 nt0.84□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 HAL9YOL089C 3093 nt0.83□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 BFR2YDR299W 1605 nt0.83□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 COX12YLR038C 252 nt0.82□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 SEC8YPR055W 3198 nt0.82□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 snR190snR190 190 nt0.81□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 snR52snR52 92 nt0.81□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.8□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.8□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 PAU12YGR294W 363 nt0.8□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 COX5BYIL111W 456 nt0.8□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 YLR282CYLR282C 342 nt0.8□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.8□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 PAU24YBR301W 363 nt0.8□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.79□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.78□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 ULI1YFR026C 510 nt0.78□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.78□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.78□□□□□ -2.28
YRM1Q12340 COG6YNL041C 2520 nt0.77□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 QCR9YGR183C 201 nt0.76□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 YML002WYML002W 2214 nt0.75□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 SEC1YDR164C 2175 nt0.75□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.75□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 YLR041WYLR041W 321 nt0.75□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.75□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 Q0092Q0092 141 nt0.74□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.73□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 PRP5YBR237W 2550 nt0.73□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 FYV10YIL097W 1551 nt0.72□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 ATP8Q0080 147 nt0.72□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.72□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.72□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 CHS6YJL099W 2241 nt0.72□□□□□ -2.29
YRM1Q12340 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.71□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 PRP42YDR235W 1635 nt0.71□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.7□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.7□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.7□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 snR39BsnR39B 96 nt0.7□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 YSP1YHR155W 3687 nt0.69□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.69□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.69□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 ULP2YIL031W 3105 nt0.69□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 YMR160WYMR160W 2451 nt0.69□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 OST4YDL232W 111 nt0.68□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.67□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 LTE1YAL024C 4308 nt0.67□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 IQG1YPL242C 4488 nt0.66□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 SDH6YDR379C-A 240 nt0.66□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 YNL170WYNL170W 396 nt0.66□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 YOL014WYOL014W 375 nt0.66□□□□□ -2.3
YRM1Q12340 RCO1YMR075W 2055 nt0.65□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 BEM3YPL115C 3387 nt0.65□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.64□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 UTP8YGR128C 2142 nt0.64□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 YDR544CYDR544C 429 nt0.63□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 YEL073CYEL073C 324 nt0.63□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 YGL182CYGL182C 324 nt0.63□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 YGR164WYGR164W 336 nt0.63□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 UTP10YJL109C 5310 nt0.63□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.62□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 YOR170WYOR170W 306 nt0.62□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.62□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 SNU13YEL026W 381 nt0.61□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 snR48snR48 113 nt0.61□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.6□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 BIR1YJR089W 2865 nt0.6□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 TAH1YCR060W 336 nt0.6□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 YDR210WYDR210W 228 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 YOR102WYOR102W 351 nt0.59□□□□□ -2.31
YRM1Q12340 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.59□□□□□ -2.31
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