Protein–RNA interactions for Protein: Q12303

YPS3, Aspartic proteinase yapsin-3, yeastyeast

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS3Q12303 SMC1YFL008W 3678 nt0.84□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 MYO1YHR023W 5787 nt0.84□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.83□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.83□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 ASE1YOR058C 2658 nt0.82□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 PRP42YDR235W 1635 nt0.82□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 DOP1YDR141C 5097 nt0.81□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 NOP9YJL010C 2001 nt0.81□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 YNL170WYNL170W 396 nt0.81□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 ROM2YLR371W 4071 nt0.81□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 YLR282CYLR282C 342 nt0.8□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 YOR170WYOR170W 306 nt0.8□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 PRP5YBR237W 2550 nt0.79□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 KAP120YPL125W 3099 nt0.79□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 BFR2YDR299W 1605 nt0.78□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 STF2YGR008C 255 nt0.78□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 HUG1YML058W-A 207 nt0.78□□□□□ -2.28
YPS3Q12303 SDH6YDR379C-A 240 nt0.77□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 YGR164WYGR164W 336 nt0.77□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 COX5BYIL111W 456 nt0.77□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 snR190snR190 190 nt0.77□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 SCC2YDR180W 4482 nt0.77□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 UBP3YER151C 2739 nt0.75□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 FYV10YIL097W 1551 nt0.75□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.75□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.75□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 YOR102WYOR102W 351 nt0.75□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 UTP8YGR128C 2142 nt0.74□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 YGL182CYGL182C 324 nt0.74□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.74□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 YLR041WYLR041W 321 nt0.74□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 PAU24YBR301W 363 nt0.74□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 YML002WYML002W 2214 nt0.74□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 TAH1YCR060W 336 nt0.73□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 RPL26BYGR034W 384 nt0.73□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 snR48snR48 113 nt0.73□□□□□ -2.29
YPS3Q12303 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.71□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.71□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 RKR1YMR247C 4689 nt0.7□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 YDR544CYDR544C 429 nt0.7□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.7□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 YDL073WYDL073W 2955 nt0.69□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.69□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 snR39BsnR39B 96 nt0.69□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 CHS6YJL099W 2241 nt0.68□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 SNU13YEL026W 381 nt0.67□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.67□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.67□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 YLR232WYLR232W 348 nt0.66□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 SEC8YPR055W 3198 nt0.65□□□□□ -2.3
YPS3Q12303 QCR9YGR183C 201 nt0.65□□□□□ -2.31
YPS3Q12303 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.65□□□□□ -2.31
YPS3Q12303 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.65□□□□□ -2.31
YPS3Q12303 PRP16YKR086W 3216 nt0.65□□□□□ -2.31
YPS3Q12303 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.62□□□□□ -2.31
YPS3Q12303 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.62□□□□□ -2.31
YPS3Q12303 SEC1YDR164C 2175 nt0.61□□□□□ -2.31
YPS3Q12303 COG6YNL041C 2520 nt0.6□□□□□ -2.31
YPS3Q12303 OST4YDL232W 111 nt0.6□□□□□ -2.31
YPS3Q12303 YDR210WYDR210W 228 nt0.6□□□□□ -2.31
YPS3Q12303 Q0143Q0143 153 nt0.6□□□□□ -2.31
YPS3Q12303 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.58□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.58□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 BEM3YPL115C 3387 nt0.58□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 SOM1YEL059C-A 225 nt0.55□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.55□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.55□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 YNL205CYNL205C 423 nt0.55□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 UTP20YBL004W 7482 nt0.55□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 PAU12YGR294W 363 nt0.54□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.54□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 YBR099CYBR099C 384 nt0.54□□□□□ -2.32
YPS3Q12303 YSP1YHR155W 3687 nt0.53□□□□□ -2.32
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