Protein–RNA interactions for Protein: Q08904

RDR1, Protein RDR1, yeastyeast

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDR1Q08904 YLR041WYLR041W 321 nt1.02□□□□□ -2.25
RDR1Q08904 SPT7YBR081C 3999 nt1.02□□□□□ -2.25
RDR1Q08904 YEL073CYEL073C 324 nt1.01□□□□□ -2.25
RDR1Q08904 YGR151CYGR151C 336 nt1□□□□□ -2.25
RDR1Q08904 YJR029WYJR029W 5268 nt1□□□□□ -2.25
RDR1Q08904 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1□□□□□ -2.25
RDR1Q08904 SEC8YPR055W 3198 nt1□□□□□ -2.25
RDR1Q08904 YML002WYML002W 2214 nt0.99□□□□□ -2.25
RDR1Q08904 UBP3YER151C 2739 nt0.99□□□□□ -2.25
RDR1Q08904 STF2YGR008C 255 nt0.98□□□□□ -2.25
RDR1Q08904 PRP42YDR235W 1635 nt0.97□□□□□ -2.25
RDR1Q08904 TRS65YGR166W 1683 nt0.97□□□□□ -2.25
RDR1Q08904 BEM2YER155C 6504 nt0.96□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.96□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 HUG1YML058W-A 207 nt0.96□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.96□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.96□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 FYV10YIL097W 1551 nt0.95□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 PRP5YBR237W 2550 nt0.94□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.93□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.93□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 YLR294CYLR294C 330 nt0.91□□□□□ -2.26
RDR1Q08904 UTP8YGR128C 2142 nt0.89□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 SCC2YDR180W 4482 nt0.89□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 YNL338WYNL338W 159 nt0.89□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 TAH1YCR060W 336 nt0.88□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 YGL182CYGL182C 324 nt0.88□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.88□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.88□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 RPM2YML091C 3609 nt0.88□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.87□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 DOP1YDR141C 5097 nt0.87□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 RKR1YMR247C 4689 nt0.86□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 CHS6YJL099W 2241 nt0.86□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 YPR117WYPR117W 7470 nt0.85□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 OST4YDL232W 111 nt0.85□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 YOR170WYOR170W 306 nt0.84□□□□□ -2.27
RDR1Q08904 SNU13YEL026W 381 nt0.83□□□□□ -2.28
RDR1Q08904 YLR232WYLR232W 348 nt0.83□□□□□ -2.28
RDR1Q08904 snR48snR48 113 nt0.83□□□□□ -2.28
RDR1Q08904 YSP1YHR155W 3687 nt0.82□□□□□ -2.28
RDR1Q08904 PAU24YBR301W 363 nt0.81□□□□□ -2.28
RDR1Q08904 YBL053WYBL053W 375 nt0.79□□□□□ -2.28
RDR1Q08904 YOR102WYOR102W 351 nt0.79□□□□□ -2.28
RDR1Q08904 BEM3YPL115C 3387 nt0.79□□□□□ -2.28
RDR1Q08904 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.77□□□□□ -2.29
RDR1Q08904 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.75□□□□□ -2.29
RDR1Q08904 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.74□□□□□ -2.29
RDR1Q08904 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.74□□□□□ -2.29
RDR1Q08904 LTE1YAL024C 4308 nt0.74□□□□□ -2.29
RDR1Q08904 ULP2YIL031W 3105 nt0.73□□□□□ -2.29
RDR1Q08904 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.73□□□□□ -2.29
RDR1Q08904 YDR544CYDR544C 429 nt0.73□□□□□ -2.29
RDR1Q08904 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.73□□□□□ -2.29
RDR1Q08904 SEC1YDR164C 2175 nt0.72□□□□□ -2.29
RDR1Q08904 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.72□□□□□ -2.29
RDR1Q08904 COG6YNL041C 2520 nt0.72□□□□□ -2.29
RDR1Q08904 BUL2YML111W 2763 nt0.71□□□□□ -2.3
RDR1Q08904 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.71□□□□□ -2.3
RDR1Q08904 MYO1YHR023W 5787 nt0.7□□□□□ -2.3
RDR1Q08904 NNF2YGR089W 2811 nt0.69□□□□□ -2.3
RDR1Q08904 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.69□□□□□ -2.3
RDR1Q08904 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.69□□□□□ -2.3
RDR1Q08904 SDH6YDR379C-A 240 nt0.68□□□□□ -2.3
RDR1Q08904 snR39BsnR39B 96 nt0.68□□□□□ -2.3
RDR1Q08904 GLG1YKR058W 1851 nt0.67□□□□□ -2.3
RDR1Q08904 QCR9YGR183C 201 nt0.66□□□□□ -2.3
RDR1Q08904 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.66□□□□□ -2.3
RDR1Q08904 UTP20YBL004W 7482 nt0.66□□□□□ -2.3
RDR1Q08904 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.65□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 YMR160WYMR160W 2451 nt0.65□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 NIP1YMR309C 2439 nt0.65□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.64□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 YGR164WYGR164W 336 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 PET111YMR257C 2403 nt0.63□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 YDR210WYDR210W 228 nt0.62□□□□□ -2.31
RDR1Q08904 PAU12YGR294W 363 nt0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 77.4 ms