Protein–RNA interactions for Protein: Q03337

TRS31, Trafficking protein particle complex subunit 31, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRS31Q03337 SIP4YJL089W 2490 nt1.13□□□□□ -2.23
TRS31Q03337 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.13□□□□□ -2.23
TRS31Q03337 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.13□□□□□ -2.23
TRS31Q03337 YLR294CYLR294C 330 nt1.13□□□□□ -2.23
TRS31Q03337 RAD9YDR217C 3930 nt1.12□□□□□ -2.23
TRS31Q03337 FYV10YIL097W 1551 nt1.12□□□□□ -2.23
TRS31Q03337 YLR041WYLR041W 321 nt1.11□□□□□ -2.23
TRS31Q03337 SPT7YBR081C 3999 nt1.1□□□□□ -2.23
TRS31Q03337 NST1YNL091W 3723 nt1.1□□□□□ -2.23
TRS31Q03337 PRP16YKR086W 3216 nt1.09□□□□□ -2.24
TRS31Q03337 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.08□□□□□ -2.24
TRS31Q03337 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.07□□□□□ -2.24
TRS31Q03337 VAM6YDL077C 3150 nt1.06□□□□□ -2.24
TRS31Q03337 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
TRS31Q03337 YPR117WYPR117W 7470 nt1.05□□□□□ -2.24
TRS31Q03337 TAH1YCR060W 336 nt1.03□□□□□ -2.24
TRS31Q03337 YGL182CYGL182C 324 nt1.03□□□□□ -2.24
TRS31Q03337 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.02□□□□□ -2.25
TRS31Q03337 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.01□□□□□ -2.25
TRS31Q03337 YLR232WYLR232W 348 nt1.01□□□□□ -2.25
TRS31Q03337 DOP1YDR141C 5097 nt1□□□□□ -2.25
TRS31Q03337 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1□□□□□ -2.25
TRS31Q03337 SCC2YDR180W 4482 nt0.99□□□□□ -2.25
TRS31Q03337 BEM2YER155C 6504 nt0.99□□□□□ -2.25
TRS31Q03337 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.98□□□□□ -2.25
TRS31Q03337 YOR102WYOR102W 351 nt0.98□□□□□ -2.25
TRS31Q03337 UBP3YER151C 2739 nt0.97□□□□□ -2.25
TRS31Q03337 STF2YGR008C 255 nt0.97□□□□□ -2.25
TRS31Q03337 YOR170WYOR170W 306 nt0.97□□□□□ -2.25
TRS31Q03337 SNU13YEL026W 381 nt0.96□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 snR48snR48 113 nt0.96□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 BEM3YPL115C 3387 nt0.96□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 RKR1YMR247C 4689 nt0.95□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 YDL073WYDL073W 2955 nt0.95□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 CHS6YJL099W 2241 nt0.95□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 YSP1YHR155W 3687 nt0.94□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 OST4YDL232W 111 nt0.93□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 HUG1YML058W-A 207 nt0.93□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 YJR029WYJR029W 5268 nt0.92□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.92□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 YDR544CYDR544C 429 nt0.91□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 YBL053WYBL053W 375 nt0.91□□□□□ -2.26
TRS31Q03337 PAU24YBR301W 363 nt0.9□□□□□ -2.27
TRS31Q03337 BUD3YCL014W 4911 nt0.9□□□□□ -2.27
TRS31Q03337 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.89□□□□□ -2.27
TRS31Q03337 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.88□□□□□ -2.27
TRS31Q03337 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.86□□□□□ -2.27
TRS31Q03337 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.86□□□□□ -2.27
TRS31Q03337 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.86□□□□□ -2.27
TRS31Q03337 SEC1YDR164C 2175 nt0.84□□□□□ -2.27
TRS31Q03337 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.84□□□□□ -2.27
TRS31Q03337 COG6YNL041C 2520 nt0.84□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.83□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 QCR9YGR183C 201 nt0.82□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 RPM2YML091C 3609 nt0.82□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 SDH6YDR379C-A 240 nt0.81□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 NNF2YGR089W 2811 nt0.81□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 ULP2YIL031W 3105 nt0.8□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 YGR164WYGR164W 336 nt0.8□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.8□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 GLG1YKR058W 1851 nt0.8□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 LTE1YAL024C 4308 nt0.79□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.79□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.78□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 snR39BsnR39B 96 nt0.78□□□□□ -2.28
TRS31Q03337 YDR210WYDR210W 228 nt0.77□□□□□ -2.29
TRS31Q03337 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.75□□□□□ -2.29
TRS31Q03337 PET111YMR257C 2403 nt0.75□□□□□ -2.29
TRS31Q03337 ATP8Q0080 147 nt0.75□□□□□ -2.29
TRS31Q03337 YNL170WYNL170W 396 nt0.74□□□□□ -2.29
TRS31Q03337 Q0092Q0092 141 nt0.73□□□□□ -2.29
TRS31Q03337 UTP20YBL004W 7482 nt0.73□□□□□ -2.29
TRS31Q03337 NIP1YMR309C 2439 nt0.7□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.7□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 PAU12YGR294W 363 nt0.7□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.69□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.69□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.69□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.69□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.69□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 RPS26AYGL189C 360 nt0.68□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 BUL2YML111W 2763 nt0.68□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.68□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 CSE1YGL238W 2883 nt0.68□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.67□□□□□ -2.3
TRS31Q03337 YMR160WYMR160W 2451 nt0.65□□□□□ -2.31
TRS31Q03337 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.64□□□□□ -2.31
TRS31Q03337 MLP1YKR095W 5628 nt0.64□□□□□ -2.31
TRS31Q03337 SOM1YEL059C-A 225 nt0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms