Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB1Q02641 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AP005121.2-201ENST00000583306 1101 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms