Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN2Q02246 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms