Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSF1Q00613 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms