Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms