Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERVK_113P61574 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms