Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME5P56597 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME5P56597 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME5P56597 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME5P56597 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms