Protein–RNA interactions for Protein: P54070

KTR6, Mannosyltransferase KTR6, yeast

Predictions only

Length 446 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR6	P54070	tT(AGU)J	tT(AGU)J	73 nt		0.73	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	tT(AGU)N1	tT(AGU)N1	73 nt		0.73	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	tT(AGU)N2	tT(AGU)N2	73 nt		0.73	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	tT(AGU)O1	tT(AGU)O1	73 nt		0.73	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	tT(AGU)O2	tT(AGU)O2	73 nt		0.73	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	YLR282C	YLR282C	342 nt		0.73	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	YPR159C-A	YPR159C-A	102 nt		0.73	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	YCR018C-A	YCR018C-A	255 nt		0.72	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		0.72	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	YGL123C-A	YGL123C-A	231 nt		0.72	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	YLR041W	YLR041W	321 nt		0.72	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		0.72	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	PRP5	YBR237W	2550 nt		0.72	□□□□□ -2.29
KTR6	P54070	tN(GUU)Q	tN(GUU)Q	71 nt		0.71	□□□□□ -2.3
KTR6	P54070	COX5B	YIL111W	456 nt		0.7	□□□□□ -2.3
KTR6	P54070	JLP2	YMR132C	627 nt		0.7	□□□□□ -2.3
KTR6	P54070	CHS6	YJL099W	2241 nt		0.7	□□□□□ -2.3
KTR6	P54070	YIL002W-A	YIL002W-A	210 nt		0.69	□□□□□ -2.3
KTR6	P54070	FYV10	YIL097W	1551 nt		0.68	□□□□□ -2.3
KTR6	P54070	SEC8	YPR055W	3198 nt		0.67	□□□□□ -2.3
KTR6	P54070	SPG3	YDR504C	384 nt		0.67	□□□□□ -2.3
KTR6	P54070	YMR160W	YMR160W	2451 nt		0.67	□□□□□ -2.3
KTR6	P54070	LTE1	YAL024C	4308 nt		0.67	□□□□□ -2.3
KTR6	P54070	snR46	snR46	197 nt		0.66	□□□□□ -2.3
KTR6	P54070	PRP39	YML046W	1890 nt		0.65	□□□□□ -2.3
KTR6	P54070	tF(GAA)B	tF(GAA)B	73 nt		0.65	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	tF(GAA)F	tF(GAA)F	73 nt		0.65	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	tF(GAA)G	tF(GAA)G	73 nt		0.65	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	tF(GAA)H1	tF(GAA)H1	73 nt		0.65	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	tF(GAA)H2	tF(GAA)H2	73 nt		0.65	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	tF(GAA)M	tF(GAA)M	73 nt		0.65	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	tF(GAA)P1	tF(GAA)P1	73 nt		0.65	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	tF(GAA)P2	tF(GAA)P2	73 nt		0.65	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	YEL014C	YEL014C	306 nt		0.65	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	BLI1	YKL061W	342 nt		0.65	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	YMR272W-A	YMR272W-A	114 nt		0.65	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	OST4	YDL232W	111 nt		0.64	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	YJL182C	YJL182C	318 nt		0.64	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	YLR399W-A	YLR399W-A	105 nt		0.64	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	YML002W	YML002W	2214 nt		0.63	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	UTP20	YBL004W	7482 nt		0.61	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	PRP42	YDR235W	1635 nt		0.6	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	QCR9	YGR183C	201 nt		0.59	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	YJL150W	YJL150W	303 nt		0.59	□□□□□ -2.31
KTR6	P54070	UTP10	YJL109C	5310 nt		0.59	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	PAU12	YGR294W	363 nt		0.58	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		0.58	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	YKL100W-A	YKL100W-A	90 nt		0.58	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		0.58	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	YOR192C-B	YOR192C-B	5313 nt		0.57	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	YJL127W-A	YJL127W-A	117 nt		0.56	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	YBL039C-A	YBL039C-A	84 nt		0.56	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	SNU13	YEL026W	381 nt		0.55	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		0.55	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	TAH1	YCR060W	336 nt		0.54	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		0.54	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	YKL145W-A	YKL145W-A	93 nt		0.54	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	snR52	snR52	92 nt		0.54	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	BUL2	YML111W	2763 nt		0.54	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	TRS65	YGR166W	1683 nt		0.53	□□□□□ -2.32
KTR6	P54070	YSP1	YHR155W	3687 nt		0.52	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	YGL182C	YGL182C	324 nt		0.52	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	YOL014W	YOL014W	375 nt		0.51	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	FMP27	YLR454W	7887 nt		0.49	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	YDR544C	YDR544C	429 nt		0.49	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	YLR232W	YLR232W	348 nt		0.49	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	YNL198C	YNL198C	303 nt		0.49	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	YOR381W-A	YOR381W-A	168 nt		0.49	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	UTP8	YGR128C	2142 nt		0.49	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	BEM3	YPL115C	3387 nt		0.48	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	NNF2	YGR089W	2811 nt		0.48	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	ULP2	YIL031W	3105 nt		0.48	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	YEL073C	YEL073C	324 nt		0.47	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		0.47	□□□□□ -2.33
KTR6	P54070	NIP1	YMR309C	2439 nt		0.46	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	ORC3	YLL004W	1851 nt		0.46	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	YDR371C-A	YDR371C-A	105 nt		0.46	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	RPS26A	YGL189C	360 nt		0.46	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	SDH6	YDR379C-A	240 nt		0.45	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	PET111	YMR257C	2403 nt		0.45	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		0.44	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	YBL053W	YBL053W	375 nt		0.44	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	YOR170W	YOR170W	306 nt		0.44	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	SBH1	YER087C-B	249 nt		0.43	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		0.43	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	YBR072C-A	YBR072C-A	162 nt		0.43	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	COG6	YNL041C	2520 nt		0.42	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		0.42	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		0.41	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	snR39B	snR39B	96 nt		0.41	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	YNL054W-B	YNL054W-B	5250 nt		0.41	□□□□□ -2.34
KTR6	P54070	ESP1	YGR098C	4893 nt		0.4	□□□□□ -2.35
KTR6	P54070	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		0.4	□□□□□ -2.35
KTR6	P54070	snR48	snR48	113 nt		0.4	□□□□□ -2.35
KTR6	P54070	AI1	Q0050	2505 nt		0.39	□□□□□ -2.35
KTR6	P54070	RCO1	YMR075W	2055 nt		0.39	□□□□□ -2.35
KTR6	P54070	YBL100W-B	YBL100W-B	5313 nt		0.38	□□□□□ -2.35
KTR6	P54070	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		0.38	□□□□□ -2.35
KTR6	P54070	YNL337W	YNL337W	255 nt		0.37	□□□□□ -2.35
KTR6	P54070	GLG1	YKR058W	1851 nt		0.37	□□□□□ -2.35

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