Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM4P49221 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM4P49221 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM4P49221 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM4P49221 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM4P49221 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM4P49221 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM4P49221 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM4P49221 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM4P49221 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM4P49221 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM4P49221 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM4P49221 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM4P49221 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM4P49221 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM4P49221 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM4P49221 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM4P49221 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM4P49221 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms