Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NESP48681 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NESP48681 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NESP48681 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NESP48681 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NESP48681 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NESP48681 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NESP48681 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NESP48681 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NESP48681 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NESP48681 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NESP48681 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NESP48681 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NESP48681 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NESP48681 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NESP48681 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NESP48681 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NESP48681 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NESP48681 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NESP48681 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NESP48681 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NESP48681 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NESP48681 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NESP48681 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NESP48681 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NESP48681 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NESP48681 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NESP48681 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NESP48681 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NESP48681 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
NESP48681 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
NESP48681 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
NESP48681 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NESP48681 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
NESP48681 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
NESP48681 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NESP48681 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NESP48681 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NESP48681 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NESP48681 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NESP48681 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
NESP48681 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
NESP48681 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NESP48681 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NESP48681 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NESP48681 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NESP48681 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NESP48681 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
NESP48681 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NESP48681 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NESP48681 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NESP48681 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NESP48681 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NESP48681 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
NESP48681 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
NESP48681 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NESP48681 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NESP48681 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NESP48681 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NESP48681 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NESP48681 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NESP48681 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NESP48681 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
NESP48681 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NESP48681 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NESP48681 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NESP48681 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NESP48681 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NESP48681 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NESP48681 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NESP48681 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NESP48681 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NESP48681 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NESP48681 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NESP48681 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms