Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 HAL9YOL089C 3093 nt1.06□□□□□ -2.24
PUS4P48567 CLU1YMR012W 3834 nt1.05□□□□□ -2.24
PUS4P48567 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.03□□□□□ -2.24
PUS4P48567 HUG1YML058W-A 207 nt1.03□□□□□ -2.24
PUS4P48567 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.03□□□□□ -2.24
PUS4P48567 STF2YGR008C 255 nt1.02□□□□□ -2.25
PUS4P48567 NST1YNL091W 3723 nt1.02□□□□□ -2.25
PUS4P48567 BEM3YPL115C 3387 nt1.02□□□□□ -2.25
PUS4P48567 YDL073WYDL073W 2955 nt1.01□□□□□ -2.25
PUS4P48567 KAP120YPL125W 3099 nt1□□□□□ -2.25
PUS4P48567 TRS65YGR166W 1683 nt1□□□□□ -2.25
PUS4P48567 PRP39YML046W 1890 nt0.99□□□□□ -2.25
PUS4P48567 UBP3YER151C 2739 nt0.99□□□□□ -2.25
PUS4P48567 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.99□□□□□ -2.25
PUS4P48567 IML1YJR138W 4755 nt0.98□□□□□ -2.25
PUS4P48567 TAH1YCR060W 336 nt0.98□□□□□ -2.25
PUS4P48567 LAA1YJL207C 6045 nt0.98□□□□□ -2.25
PUS4P48567 SCC2YDR180W 4482 nt0.98□□□□□ -2.25
PUS4P48567 YPR117WYPR117W 7470 nt0.97□□□□□ -2.25
PUS4P48567 YLR041WYLR041W 321 nt0.96□□□□□ -2.26
PUS4P48567 YLR232WYLR232W 348 nt0.96□□□□□ -2.26
PUS4P48567 YNL338WYNL338W 159 nt0.96□□□□□ -2.26
PUS4P48567 SIP4YJL089W 2490 nt0.96□□□□□ -2.26
PUS4P48567 BEM2YER155C 6504 nt0.95□□□□□ -2.26
PUS4P48567 CHS6YJL099W 2241 nt0.95□□□□□ -2.26
PUS4P48567 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PUS4P48567 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PUS4P48567 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PUS4P48567 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PUS4P48567 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
PUS4P48567 SNU13YEL026W 381 nt0.94□□□□□ -2.26
PUS4P48567 YGL182CYGL182C 324 nt0.94□□□□□ -2.26
PUS4P48567 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.94□□□□□ -2.26
PUS4P48567 Q0032Q0032 291 nt0.93□□□□□ -2.26
PUS4P48567 YDR544CYDR544C 429 nt0.93□□□□□ -2.26
PUS4P48567 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.92□□□□□ -2.26
PUS4P48567 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.92□□□□□ -2.26
PUS4P48567 DOP1YDR141C 5097 nt0.92□□□□□ -2.26
PUS4P48567 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.91□□□□□ -2.26
PUS4P48567 OST4YDL232W 111 nt0.9□□□□□ -2.27
PUS4P48567 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.89□□□□□ -2.27
PUS4P48567 SEC1YDR164C 2175 nt0.87□□□□□ -2.27
PUS4P48567 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.87□□□□□ -2.27
PUS4P48567 YSP1YHR155W 3687 nt0.86□□□□□ -2.27
PUS4P48567 YOR225WYOR225W 330 nt0.84□□□□□ -2.27
PUS4P48567 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.82□□□□□ -2.28
PUS4P48567 YOR102WYOR102W 351 nt0.82□□□□□ -2.28
PUS4P48567 YOR170WYOR170W 306 nt0.82□□□□□ -2.28
PUS4P48567 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.82□□□□□ -2.28
PUS4P48567 NNF2YGR089W 2811 nt0.8□□□□□ -2.28
PUS4P48567 PET111YMR257C 2403 nt0.79□□□□□ -2.28
PUS4P48567 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.79□□□□□ -2.28
PUS4P48567 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.79□□□□□ -2.28
PUS4P48567 YLR294CYLR294C 330 nt0.77□□□□□ -2.29
PUS4P48567 YBL053WYBL053W 375 nt0.77□□□□□ -2.29
PUS4P48567 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.77□□□□□ -2.29
PUS4P48567 COG6YNL041C 2520 nt0.77□□□□□ -2.29
PUS4P48567 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.76□□□□□ -2.29
PUS4P48567 SDH6YDR379C-A 240 nt0.75□□□□□ -2.29
PUS4P48567 PAU12YGR294W 363 nt0.75□□□□□ -2.29
PUS4P48567 snR48snR48 113 nt0.75□□□□□ -2.29
PUS4P48567 PAU24YBR301W 363 nt0.75□□□□□ -2.29
PUS4P48567 UTP10YJL109C 5310 nt0.74□□□□□ -2.29
PUS4P48567 CSE1YGL238W 2883 nt0.74□□□□□ -2.29
PUS4P48567 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.74□□□□□ -2.29
PUS4P48567 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.74□□□□□ -2.29
PUS4P48567 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.74□□□□□ -2.29
PUS4P48567 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
PUS4P48567 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
PUS4P48567 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.74□□□□□ -2.29
PUS4P48567 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
PUS4P48567 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
PUS4P48567 QCR9YGR183C 201 nt0.73□□□□□ -2.29
PUS4P48567 MYO1YHR023W 5787 nt0.72□□□□□ -2.29
PUS4P48567 YDR210WYDR210W 228 nt0.72□□□□□ -2.29
PUS4P48567 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.72□□□□□ -2.29
PUS4P48567 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.72□□□□□ -2.29
PUS4P48567 GLG1YKR058W 1851 nt0.71□□□□□ -2.3
PUS4P48567 snR39BsnR39B 96 nt0.69□□□□□ -2.3
PUS4P48567 LTE1YAL024C 4308 nt0.68□□□□□ -2.3
PUS4P48567 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.67□□□□□ -2.3
PUS4P48567 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.67□□□□□ -2.3
PUS4P48567 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.66□□□□□ -2.3
PUS4P48567 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.66□□□□□ -2.3
PUS4P48567 SBH1YER087C-B 249 nt0.65□□□□□ -2.31
PUS4P48567 RPS26AYGL189C 360 nt0.65□□□□□ -2.31
PUS4P48567 NIP1YMR309C 2439 nt0.65□□□□□ -2.31
PUS4P48567 ULP2YIL031W 3105 nt0.64□□□□□ -2.31
PUS4P48567 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.64□□□□□ -2.31
PUS4P48567 YOL014WYOL014W 375 nt0.62□□□□□ -2.31
PUS4P48567 ORC3YLL004W 1851 nt0.61□□□□□ -2.31
PUS4P48567 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.59□□□□□ -2.31
PUS4P48567 YMR160WYMR160W 2451 nt0.59□□□□□ -2.32
PUS4P48567 MLP1YKR095W 5628 nt0.56□□□□□ -2.32
PUS4P48567 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.55□□□□□ -2.32
PUS4P48567 UTP20YBL004W 7482 nt0.52□□□□□ -2.33
PUS4P48567 BIR1YJR089W 2865 nt0.51□□□□□ -2.33
PUS4P48567 BUL2YML111W 2763 nt0.51□□□□□ -2.33
PUS4P48567 YGR164WYGR164W 336 nt0.5□□□□□ -2.33
PUS4P48567 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.5□□□□□ -2.33
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