Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 YLR041WYLR041W 321 nt1.16□□□□□ -2.22
VFA1P40080 SPT7YBR081C 3999 nt1.15□□□□□ -2.23
VFA1P40080 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.15□□□□□ -2.23
VFA1P40080 SEC8YPR055W 3198 nt1.15□□□□□ -2.23
VFA1P40080 PRP42YDR235W 1635 nt1.15□□□□□ -2.23
VFA1P40080 YLR294CYLR294C 330 nt1.14□□□□□ -2.23
VFA1P40080 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.13□□□□□ -2.23
VFA1P40080 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.13□□□□□ -2.23
VFA1P40080 PRP5YBR237W 2550 nt1.12□□□□□ -2.23
VFA1P40080 YNL338WYNL338W 159 nt1.11□□□□□ -2.23
VFA1P40080 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.11□□□□□ -2.23
VFA1P40080 FYV10YIL097W 1551 nt1.11□□□□□ -2.23
VFA1P40080 UTP8YGR128C 2142 nt1.1□□□□□ -2.23
VFA1P40080 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.1□□□□□ -2.23
VFA1P40080 VAM6YDL077C 3150 nt1.09□□□□□ -2.23
VFA1P40080 NST1YNL091W 3723 nt1.09□□□□□ -2.23
VFA1P40080 RAD9YDR217C 3930 nt1.09□□□□□ -2.24
VFA1P40080 BUD3YCL014W 4911 nt1.08□□□□□ -2.24
VFA1P40080 YPR117WYPR117W 7470 nt1.07□□□□□ -2.24
VFA1P40080 YJR029WYJR029W 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
VFA1P40080 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
VFA1P40080 DOP1YDR141C 5097 nt1.07□□□□□ -2.24
VFA1P40080 SCC2YDR180W 4482 nt1.06□□□□□ -2.24
VFA1P40080 YDL073WYDL073W 2955 nt1.05□□□□□ -2.24
VFA1P40080 YGL182CYGL182C 324 nt1.04□□□□□ -2.24
VFA1P40080 PAU12YGR294W 363 nt1.03□□□□□ -2.24
VFA1P40080 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.03□□□□□ -2.24
VFA1P40080 PAU24YBR301W 363 nt1.03□□□□□ -2.24
VFA1P40080 TAH1YCR060W 336 nt1.02□□□□□ -2.25
VFA1P40080 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.01□□□□□ -2.25
VFA1P40080 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.01□□□□□ -2.25
VFA1P40080 YOR170WYOR170W 306 nt1□□□□□ -2.25
VFA1P40080 YLR232WYLR232W 348 nt0.99□□□□□ -2.25
VFA1P40080 snR48snR48 113 nt0.99□□□□□ -2.25
VFA1P40080 SNU13YEL026W 381 nt0.97□□□□□ -2.25
VFA1P40080 OST4YDL232W 111 nt0.96□□□□□ -2.26
VFA1P40080 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.96□□□□□ -2.26
VFA1P40080 RKR1YMR247C 4689 nt0.96□□□□□ -2.26
VFA1P40080 YOR102WYOR102W 351 nt0.96□□□□□ -2.26
VFA1P40080 CHS6YJL099W 2241 nt0.96□□□□□ -2.26
VFA1P40080 YSP1YHR155W 3687 nt0.95□□□□□ -2.26
VFA1P40080 RPM2YML091C 3609 nt0.95□□□□□ -2.26
VFA1P40080 UBP3YER151C 2739 nt0.95□□□□□ -2.26
VFA1P40080 YBL053WYBL053W 375 nt0.94□□□□□ -2.26
VFA1P40080 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.93□□□□□ -2.26
VFA1P40080 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
VFA1P40080 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
VFA1P40080 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.93□□□□□ -2.26
VFA1P40080 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
VFA1P40080 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.92□□□□□ -2.26
VFA1P40080 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.9□□□□□ -2.27
VFA1P40080 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.9□□□□□ -2.27
VFA1P40080 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.9□□□□□ -2.27
VFA1P40080 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
VFA1P40080 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
VFA1P40080 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.9□□□□□ -2.27
VFA1P40080 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
VFA1P40080 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
VFA1P40080 BEM3YPL115C 3387 nt0.9□□□□□ -2.27
VFA1P40080 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.89□□□□□ -2.27
VFA1P40080 QCR9YGR183C 201 nt0.89□□□□□ -2.27
VFA1P40080 YDR544CYDR544C 429 nt0.88□□□□□ -2.27
VFA1P40080 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.86□□□□□ -2.27
VFA1P40080 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.85□□□□□ -2.27
VFA1P40080 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.85□□□□□ -2.27
VFA1P40080 COG6YNL041C 2520 nt0.84□□□□□ -2.27
VFA1P40080 LTE1YAL024C 4308 nt0.84□□□□□ -2.27
VFA1P40080 SEC1YDR164C 2175 nt0.83□□□□□ -2.28
VFA1P40080 ULP2YIL031W 3105 nt0.83□□□□□ -2.28
VFA1P40080 UTP20YBL004W 7482 nt0.81□□□□□ -2.28
VFA1P40080 YGR164WYGR164W 336 nt0.81□□□□□ -2.28
VFA1P40080 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.81□□□□□ -2.28
VFA1P40080 SDH6YDR379C-A 240 nt0.8□□□□□ -2.28
VFA1P40080 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.8□□□□□ -2.28
VFA1P40080 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.8□□□□□ -2.28
VFA1P40080 snR39BsnR39B 96 nt0.8□□□□□ -2.28
VFA1P40080 NNF2YGR089W 2811 nt0.8□□□□□ -2.28
VFA1P40080 GLG1YKR058W 1851 nt0.8□□□□□ -2.28
VFA1P40080 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.78□□□□□ -2.28
VFA1P40080 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.76□□□□□ -2.29
VFA1P40080 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.76□□□□□ -2.29
VFA1P40080 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.76□□□□□ -2.29
VFA1P40080 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.76□□□□□ -2.29
VFA1P40080 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
VFA1P40080 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
VFA1P40080 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.76□□□□□ -2.29
VFA1P40080 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
VFA1P40080 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
VFA1P40080 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
VFA1P40080 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
VFA1P40080 YOL014WYOL014W 375 nt0.76□□□□□ -2.29
VFA1P40080 YDR210WYDR210W 228 nt0.75□□□□□ -2.29
VFA1P40080 ATP8Q0080 147 nt0.74□□□□□ -2.29
VFA1P40080 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.74□□□□□ -2.29
VFA1P40080 BUL2YML111W 2763 nt0.74□□□□□ -2.29
VFA1P40080 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.73□□□□□ -2.29
VFA1P40080 PET111YMR257C 2403 nt0.73□□□□□ -2.29
VFA1P40080 NIP1YMR309C 2439 nt0.73□□□□□ -2.29
VFA1P40080 YMR160WYMR160W 2451 nt0.72□□□□□ -2.29
VFA1P40080 Q0092Q0092 141 nt0.72□□□□□ -2.29
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