Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4A3P38919 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms