Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIAP25963 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIAP25963 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms