Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KB1P23443 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms