Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL17P18621 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL17P18621 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL17P18621 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL17P18621 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL17P18621 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL17P18621 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL17P18621 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL17P18621 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL17P18621 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL17P18621 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL17P18621 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL17P18621 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL17P18621 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL17P18621 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL17P18621 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL17P18621 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms