Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XBP1P17861 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XBP1P17861 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XBP1P17861 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XBP1P17861 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
XBP1P17861 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XBP1P17861 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms