Protein–RNA interactions for Protein: P16658

SEN2, tRNA-splicing endonuclease subunit SEN2, yeastyeast

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEN2P16658 YLR041WYLR041W 321 nt-0.24□□□□□ -2.45
SEN2P16658 GLG1YKR058W 1851 nt-0.24□□□□□ -2.45
SEN2P16658 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-0.25□□□□□ -2.45
SEN2P16658 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.25□□□□□ -2.45
SEN2P16658 YOR121CYOR121C 306 nt-0.25□□□□□ -2.45
SEN2P16658 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.26□□□□□ -2.45
SEN2P16658 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-0.27□□□□□ -2.45
SEN2P16658 BIL1YOR304C-A 231 nt-0.27□□□□□ -2.45
SEN2P16658 RAD61YDR014W 1944 nt-0.28□□□□□ -2.45
SEN2P16658 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.28□□□□□ -2.45
SEN2P16658 snR60snR60 104 nt-0.29□□□□□ -2.46
SEN2P16658 SEC10YLR166C 2616 nt-0.3□□□□□ -2.46
SEN2P16658 YFL063WYFL063W 456 nt-0.31□□□□□ -2.46
SEN2P16658 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-0.31□□□□□ -2.46
SEN2P16658 YBR099CYBR099C 384 nt-0.32□□□□□ -2.46
SEN2P16658 EST1YLR233C 2100 nt-0.32□□□□□ -2.46
SEN2P16658 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-0.33□□□□□ -2.46
SEN2P16658 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.34□□□□□ -2.46
SEN2P16658 YER079WYER079W 633 nt-0.34□□□□□ -2.46
SEN2P16658 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-0.34□□□□□ -2.46
SEN2P16658 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.35□□□□□ -2.47
SEN2P16658 AGA2YGL032C 264 nt-0.36□□□□□ -2.47
SEN2P16658 YNL324WYNL324W 396 nt-0.36□□□□□ -2.47
SEN2P16658 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.37□□□□□ -2.47
SEN2P16658 YGR069WYGR069W 336 nt-0.38□□□□□ -2.47
SEN2P16658 YJR157WYJR157W 363 nt-0.38□□□□□ -2.47
SEN2P16658 YDR544CYDR544C 429 nt-0.39□□□□□ -2.47
SEN2P16658 URB1YKL014C 5295 nt-0.4□□□□□ -2.47
SEN2P16658 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.4□□□□□ -2.47
SEN2P16658 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.4□□□□□ -2.47
SEN2P16658 YIL032CYIL032C 357 nt-0.4□□□□□ -2.47
SEN2P16658 APQ12YIL040W 417 nt-0.41□□□□□ -2.48
SEN2P16658 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-0.41□□□□□ -2.48
SEN2P16658 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-0.41□□□□□ -2.48
SEN2P16658 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-0.41□□□□□ -2.48
SEN2P16658 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-0.41□□□□□ -2.48
SEN2P16658 YGR035CYGR035C 351 nt-0.42□□□□□ -2.48
SEN2P16658 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.42□□□□□ -2.48
SEN2P16658 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.43□□□□□ -2.48
SEN2P16658 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.44□□□□□ -2.48
SEN2P16658 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.44□□□□□ -2.48
SEN2P16658 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.44□□□□□ -2.48
SEN2P16658 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.44□□□□□ -2.48
SEN2P16658 YNL028WYNL028W 318 nt-0.44□□□□□ -2.48
SEN2P16658 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-0.46□□□□□ -2.48
SEN2P16658 snR161snR161 161 nt-0.46□□□□□ -2.48
SEN2P16658 RPM2YML091C 3609 nt-0.46□□□□□ -2.48
SEN2P16658 YGL149WYGL149W 306 nt-0.48□□□□□ -2.49
SEN2P16658 Q0017Q0017 162 nt-0.48□□□□□ -2.49
SEN2P16658 HMRA1YCR097W 381 nt-0.5□□□□□ -2.49
SEN2P16658 snR36snR36 182 nt-0.5□□□□□ -2.49
SEN2P16658 HTL1YCR020W-B 237 nt-0.51□□□□□ -2.49
SEN2P16658 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.51□□□□□ -2.49
SEN2P16658 COG6YNL041C 2520 nt-0.52□□□□□ -2.49
SEN2P16658 ATP6Q0085 780 nt-0.53□□□□□ -2.49
SEN2P16658 YNR077CYNR077C 255 nt-0.53□□□□□ -2.49
SEN2P16658 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.56□□□□□ -2.5
SEN2P16658 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-0.56□□□□□ -2.5
SEN2P16658 YAF9YNL107W 681 nt-0.56□□□□□ -2.5
SEN2P16658 snR74snR74 88 nt-0.57□□□□□ -2.5
SEN2P16658 YOR015WYOR015W 360 nt-0.57□□□□□ -2.5
SEN2P16658 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-0.58□□□□□ -2.5
SEN2P16658 YDR102CYDR102C 333 nt-0.59□□□□□ -2.5
SEN2P16658 YDR157WYDR157W 402 nt-0.59□□□□□ -2.5
SEN2P16658 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-0.59□□□□□ -2.5
SEN2P16658 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.6□□□□□ -2.51
SEN2P16658 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.61□□□□□ -2.51
SEN2P16658 YGL052WYGL052W 306 nt-0.61□□□□□ -2.51
SEN2P16658 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.61□□□□□ -2.51
SEN2P16658 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.61□□□□□ -2.51
SEN2P16658 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-0.62□□□□□ -2.51
SEN2P16658 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.64□□□□□ -2.51
SEN2P16658 YML099W-AYML099W-A 330 nt-0.64□□□□□ -2.51
SEN2P16658 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.64□□□□□ -2.51
SEN2P16658 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-0.64□□□□□ -2.51
SEN2P16658 snR33snR33 183 nt-0.64□□□□□ -2.51
SEN2P16658 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-0.65□□□□□ -2.51
SEN2P16658 YFL032WYFL032W 321 nt-0.65□□□□□ -2.51
SEN2P16658 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.65□□□□□ -2.51
SEN2P16658 YGL041CYGL041C 204 nt-0.66□□□□□ -2.52
SEN2P16658 YGL182CYGL182C 324 nt-0.68□□□□□ -2.52
SEN2P16658 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-0.68□□□□□ -2.52
SEN2P16658 YPR197CYPR197C 564 nt-0.68□□□□□ -2.52
SEN2P16658 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-0.69□□□□□ -2.52
SEN2P16658 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-0.69□□□□□ -2.52
SEN2P16658 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.7□□□□□ -2.52
SEN2P16658 snR49snR49 165 nt-0.71□□□□□ -2.52
SEN2P16658 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.72□□□□□ -2.52
SEN2P16658 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-0.72□□□□□ -2.52
SEN2P16658 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-0.74□□□□□ -2.53
SEN2P16658 YDR413CYDR413C 576 nt-0.75□□□□□ -2.53
SEN2P16658 YEL014CYEL014C 306 nt-0.76□□□□□ -2.53
SEN2P16658 YER097WYER097W 330 nt-0.76□□□□□ -2.53
SEN2P16658 VAR1Q0140 1197 nt-0.76□□□□□ -2.53
SEN2P16658 snR69snR69 101 nt-0.78□□□□□ -2.53
SEN2P16658 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-0.78□□□□□ -2.53
SEN2P16658 YJL182CYJL182C 318 nt-0.78□□□□□ -2.53
SEN2P16658 RPL39YJL189W 156 nt-0.78□□□□□ -2.53
SEN2P16658 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.8□□□□□ -2.54
SEN2P16658 snR39BsnR39B 96 nt-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms