Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLBP1P12271 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms