Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP3P08254 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP3P08254 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP3P08254 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP3P08254 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP3P08254 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP3P08254 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP3P08254 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP3P08254 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP3P08254 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP3P08254 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP3P08254 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP3P08254 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP3P08254 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MMP3P08254 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP3P08254 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP3P08254 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP3P08254 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP3P08254 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP3P08254 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP3P08254 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP3P08254 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP3P08254 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP3P08254 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP3P08254 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP3P08254 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP3P08254 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP3P08254 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP3P08254 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP3P08254 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP3P08254 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP3P08254 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms