Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRAP08240 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms