Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLEC3BP05452 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC3BP05452 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms