Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
F13BP05160 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F13BP05160 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F13BP05160 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F13BP05160 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms