Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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BckdkO55028 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdkO55028 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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BckdkO55028 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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BckdkO55028 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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BckdkO55028 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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BckdkO55028 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms