Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL670P-201ENST00000577235 294 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ZRANB2-AS2-206ENST00000583678 551 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 SMIM7-214ENST00000597711 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL122127.1-201ENST00000603832 327 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC01359-205ENST00000634604 1050 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AP000705.2-201ENST00000433524 1386 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ODF1-201ENST00000285402 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CTH-201ENST00000346806 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 HEATR5A-201ENST00000382464 507 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 TRAJ24-201ENST00000390513 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 NONOP2-201ENST00000414613 1231 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC111200.2-201ENST00000418877 505 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F26P-202ENST00000433357 852 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 BX322234.2-202ENST00000435612 479 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC007349.2-201ENST00000439998 553 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 SFTPA3P-201ENST00000446429 367 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC00945-201ENST00000453716 753 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 TXNP3-201ENST00000454560 301 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AP003774.3-201ENST00000457725 985 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC109811.2-201ENST00000509609 452 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AP002812.5-201ENST00000530972 712 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC005703.4-201ENST00000580422 538 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC021382.2-201ENST00000584547 922 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC137695.2-201ENST00000603123 754 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 PROX1-AS1-221ENST00000615085 673 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC245033.3-201ENST00000617986 224 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 COMMD6-205ENST00000406936 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MSL3-201ENST00000312196 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms