Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTGFRP43088 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTGFRP43088 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTGFRP43088 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTGFRP43088 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTGFRP43088 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTGFRP43088 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTGFRP43088 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTGFRP43088 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTGFRP43088 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
PTGFRP43088 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 GZMA-201ENST00000274306 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 OR4F7P-201ENST00000402444 931 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 OR4F1P-201ENST00000405102 938 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC098828.2-201ENST00000452342 573 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 C11orf70-205ENST00000534360 520 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 MS4A12-205ENST00000537076 1019 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 DCN-207ENST00000546370 586 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC092368.2-201ENST00000565911 600 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 ZNF174-205ENST00000575752 1068 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AL607028.1-201ENST00000433455 794 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC006387.1-203ENST00000494849 342 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTGFRP43088 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms