Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AKAP7-202ENST00000342266 2461 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 FO393401.2-201ENST00000422009 1307 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PSMC1P3-201ENST00000453822 1318 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MEF2C-222ENST00000514028 3393 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 2102 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 FBXO38-201ENST00000296701 3680 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MSANTD3-206ENST00000613183 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TMEM199-202ENST00000395404 971 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC00159-202ENST00000414877 428 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 HMGN2P24-201ENST00000433516 273 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR7H1P-201ENST00000448965 922 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 YAP1P2-201ENST00000455104 610 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SNX18P8-201ENST00000455120 874 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 COX7A2L-204ENST00000463055 540 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PAQR9-AS1-202ENST00000493825 576 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC008799.1-201ENST00000495909 457 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPL7AP2-201ENST00000496515 740 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC027607.1-201ENST00000503034 534 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GAPDHP31-201ENST00000509325 1014 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC108471.2-205ENST00000529314 628 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC074051.4-201ENST00000564888 892 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AP001025.3-201ENST00000578787 864 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TBC1D29-201ENST00000579181 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC010761.2-202ENST00000582536 391 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TBC1D29-204ENST00000584297 602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ZNF585B-207ENST00000586320 403 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPL23AP77-201ENST00000588044 463 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 BX255923.1-201ENST00000613309 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RN7SL301P-202ENST00000618767 298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR5AU1-204ENST00000641822 1197 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms