Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LNX1-AS2-202ENST00000509974 628 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AP003555.2-201ENST00000528507 655 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AP000436.1-201ENST00000605239 800 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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RTL8BQ17RB0 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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RTL8BQ17RB0 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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RTL8BQ17RB0 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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