Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 KIF9-203ENST00000425452 640 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC007036.1-201ENST00000430537 674 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PET100-201ENST00000456958 219 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL401P-201ENST00000470065 298 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC093010.2-201ENST00000481773 743 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL472P-201ENST00000492799 293 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RPL4P1-201ENST00000496596 1278 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 IGKV2OR22-4-201ENST00000523309 367 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 FTH1-207ENST00000532601 742 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RAB19-203ENST00000537763 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC117503.2-201ENST00000538837 321 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PCED1B-AS1-204ENST00000547851 780 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.29-201ENST00000616220 280 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC073254.1-206ENST00000617813 907 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ST13-207ENST00000620312 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC027176.3-201ENST00000624460 586 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PCAT14-203ENST00000629869 976 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PAFAH2-201ENST00000374282 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ARMC3-204ENST00000409983 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 DCLRE1C-209ENST00000378278 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL049842.1-201ENST00000402902 1479 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 OR1S1-202ENST00000641544 1474 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 TRIO-201ENST00000344135 4065 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 CREM-218ENST00000460270 1416 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZNF826P-204ENST00000597334 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 TGFB2-AS1-201ENST00000414452 557 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC007359.1-201ENST00000417910 745 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ASS1P4-201ENST00000439462 1234 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC008175.1-202ENST00000439653 745 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC006463.1-201ENST00000445929 232 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC104389.2-201ENST00000450768 887 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL353194.1-201ENST00000451507 441 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC17A1-203ENST00000468082 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 DLX5-202ENST00000486603 1074 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 KLF7P1-201ENST00000490941 1048 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AF186996.2-201ENST00000508347 907 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL4-219ENST00000534457 987 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC079031.2-201ENST00000537742 615 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZNF771-203ENST00000564550 1187 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms