Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00312Q9Y6C7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms