Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRBQ9Y5M8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms