Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms