Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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