Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP2Q9UHC6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms